BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 12, gen 0

pebcak · January 18, 2022, 6:03pm

I’m seeing these error messages from dmesg. Does it mean that I am having some file system corruption.

I had a BIOS update just earlier today. The system have been a bit unstable. Firefox crashing and some other app (flatpak) refusing to launch. Not sure exactly what is causing the instability.

[  245.480592] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20836352 csum 0x683886ee expected csum 0xdb139986 mirror 1
[  245.480598] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 5, gen 0
[  245.480605] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20762624 csum 0x593f101b expected csum 0x0078a433 mirror 1
[  245.480606] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20840448 csum 0x4df31cb1 expected csum 0xa2452bc5 mirror 1
[  245.480608] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 7, gen 0
[  245.480608] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 7, gen 0
[  245.480613] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20766720 csum 0xc19c01b5 expected csum 0x9e7777bb mirror 1
[  245.480614] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20844544 csum 0x2462448e expected csum 0x941e3f44 mirror 1
[  245.480615] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 8, gen 0
[  245.480616] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 9, gen 0
[  245.480620] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20848640 csum 0x363317ab expected csum 0x0a5c4f8e mirror 1
[  245.480622] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 10, gen 0
[  245.480735] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20865024 csum 0xe5adc731 expected csum 0x46872e06 mirror 1
[  245.480736] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 11, gen 0
[  245.480738] BTRFS warning (device nvme0n1p2): csum failed root 256 ino 2525649 off 20869120 csum 0x1239a90e expected csum 0xa6569e4b mirror 1
[  245.480739] BTRFS error (device nvme0n1p2): bdev /dev/nvme0n1p2 errs: wr 0, rd 0, flush 0, corrupt 12, gen 0

inxi -Fxxxaz


System:
  Kernel: 5.16.0-zen1-1-zen x86_64 bits: 64 compiler: gcc v: 11.1.0
    parameters: initrd=\arch-gnome\intel-ucode.img
    initrd=\arch-gnome\initramfs-linux-zen.img rw
    root=UUID=1d9646ea-0edf-423b-85a7-88a429c6314b
    rootflags=subvol=@arch-gnome-root lsm=landlock,lockdown,yama,apparmor,bpf
    nowatchdog zswap.enabled=0
  Desktop: GNOME 41.3 tk: GTK 3.24.31 wm: gnome-shell dm: GDM 41.3
    Distro: Arch Linux
Machine:
  Type: Laptop System: Dell product: XPS 13 9380 v: N/A
    serial: <superuser required> Chassis: type: 10 serial: <superuser required>
  Mobo: Dell model: 0KTDY6 v: A00 serial: <superuser required> UEFI: Dell
    v: 1.17.0 date: 12/08/2021
Battery:
  ID-1: BAT0 charge: 40.5 Wh (96.4%) condition: 42.0/52.0 Wh (80.7%)
    volts: 8.6 min: 7.6 model: LGC-LGC6.73 DELL H754V8C type: Li-ion
    serial: <filter> status: Charging
CPU:
  Info: model: Intel Core i7-8565U bits: 64 type: MT MCP arch: Whiskey Lake
    family: 6 model-id: 0x8E (142) stepping: 0xB (11) microcode: 0xEC
  Topology: cpus: 1x cores: 4 tpc: 2 threads: 8 smt: enabled cache:
    L1: 256 KiB desc: d-4x32 KiB; i-4x32 KiB L2: 1024 KiB desc: 4x256 KiB
    L3: 8 MiB desc: 1x8 MiB
  Speed (MHz): avg: 4498 high: 4601 min/max: 400/4600 scaling:
    driver: intel_pstate governor: powersave cores: 1: 4601 2: 4524 3: 4487
    4: 4319 5: 4540 6: 4510 7: 4500 8: 4510 bogomips: 31999
  Flags: avx avx2 ht lm nx pae sse sse2 sse3 sse4_1 sse4_2 ssse3 vmx
  Vulnerabilities:
  Type: itlb_multihit status: KVM: VMX disabled
  Type: l1tf status: Not affected
  Type: mds mitigation: Clear CPU buffers; SMT vulnerable
  Type: meltdown status: Not affected
  Type: spec_store_bypass
    mitigation: Speculative Store Bypass disabled via prctl
  Type: spectre_v1
    mitigation: usercopy/swapgs barriers and __user pointer sanitization
  Type: spectre_v2 mitigation: Full generic retpoline, IBPB: conditional,
    IBRS_FW, STIBP: conditional, RSB filling
  Type: srbds mitigation: Microcode
  Type: tsx_async_abort status: Not affected
Graphics:
  Device-1: Intel WhiskeyLake-U GT2 [UHD Graphics 620] vendor: Dell
    driver: i915 v: kernel bus-ID: 00:02.0 chip-ID: 8086:3ea0 class-ID: 0300
  Device-2: Microdia Integrated_Webcam_HD type: USB driver: uvcvideo
    bus-ID: 1-5:2 chip-ID: 0c45:6723 class-ID: 0e02
  Display: wayland server: X.org 1.21.1.3 compositor: gnome-shell driver:
    loaded: modesetting alternate: fbdev,intel,vesa display-ID: 0
    resolution: <missing: xdpyinfo>
  Message: Unable to show advanced data. Required tool glxinfo missing.
Audio:
  Device-1: Intel Cannon Point-LP High Definition Audio vendor: Dell
    driver: snd_hda_intel v: kernel
    alternate: snd_soc_skl,snd_sof_pci_intel_cnl bus-ID: 00:1f.3
    chip-ID: 8086:9dc8 class-ID: 0403
  Sound Server-1: ALSA v: k5.16.0-zen1-1-zen running: yes
  Sound Server-2: JACK v: 1.9.20 running: no
  Sound Server-3: PulseAudio v: 15.0 running: no
  Sound Server-4: PipeWire v: 0.3.43 running: yes
Network:
  Device-1: Qualcomm Atheros QCA6174 802.11ac Wireless Network Adapter
    vendor: Rivet Networks Killer 1435 Wireless-AC driver: ath10k_pci v: kernel
    bus-ID: 02:00.0 chip-ID: 168c:003e class-ID: 0280
  IF: wlan0 state: up mac: <filter>
  IF-ID-1: tun0 state: unknown speed: 10 Mbps duplex: full mac: N/A
Bluetooth:
  Device-1: Foxconn / Hon Hai type: USB driver: btusb v: 0.8 bus-ID: 1-7:3
    chip-ID: 0489:e0a2 class-ID: e001
  Report: rfkill ID: hci0 rfk-id: 0 state: up address: see --recommends
Drives:
  Local Storage: total: 465.76 GiB used: 189.63 GiB (40.7%)
  SMART Message: Unable to run smartctl. Root privileges required.
  ID-1: /dev/nvme0n1 maj-min: 259:0 vendor: Samsung
    model: SSD 970 EVO 500GB size: 465.76 GiB block-size: physical: 512 B
    logical: 512 B speed: 31.6 Gb/s lanes: 4 type: SSD serial: <filter>
    rev: 2B2QEXE7 temp: 39.9 C scheme: GPT
Partition:
  ID-1: / raw-size: 456.76 GiB size: 456.76 GiB (100.00%)
    used: 189.27 GiB (41.4%) fs: btrfs dev: /dev/nvme0n1p2 maj-min: 259:2
  ID-2: /home raw-size: 456.76 GiB size: 456.76 GiB (100.00%)
    used: 189.27 GiB (41.4%) fs: btrfs dev: /dev/nvme0n1p2 maj-min: 259:2
  ID-3: /var/log raw-size: 456.76 GiB size: 456.76 GiB (100.00%)
    used: 189.27 GiB (41.4%) fs: btrfs dev: /dev/nvme0n1p2 maj-min: 259:2
Swap:
  Kernel: swappiness: 10 (default 60) cache-pressure: 100 (default)
  ID-1: swap-1 type: file size: 8 GiB used: 0 KiB (0.0%) priority: -2
    file: /swap/swapfile
  ID-2: swap-2 type: zram size: 7.41 GiB used: 0 KiB (0.0%) priority: 100
    dev: /dev/zram0
Sensors:
  System Temperatures: cpu: 57.0 C pch: 47.0 C mobo: N/A
  Fan Speeds (RPM): cpu: 0 fan-2: 0
Info:
  Processes: 270 Uptime: 16m wakeups: 1667 Memory: 7.41 GiB
  used: 2.13 GiB (28.8%) Init: systemd v: 250 tool: systemctl Compilers:
  gcc: 11.1.0 Packages: 977 pacman: 955 lib: 243 flatpak: 22 Shell: Bash
  v: 5.1.16 running-in: gnome-terminal inxi: 3.3.11

I will appreciate if you could have a look and look forward your comments/suggestions.

keybreak · January 18, 2022, 6:09pm

Highly likely BIOS itself then, try to roll it back if you can

P.S. btw, in my experience BIOS is one of those things that it’s better don’t touch it if everything works as intended

pebcak · January 18, 2022, 6:11pm

Yes, that was my suspicion as well.
I’ll try later and see if I can reverse it.

But could a BIOS update cause those BTRF’s errors?

pebcak · January 18, 2022, 6:14pm

I don’t know why I get so excited about BIOS updates.
The moment I see one I have to do the update

keybreak · January 18, 2022, 6:14pm

BIOS can cause all kind of crap, it can affect your CPU performance, battery problems, power instability, i’ve also seen crazy RAM instability issues…
I haven’t seen disk errors like that before, but why not?

You have pretty decent SSD, so i doubt it’s dyeing…

Perhaps it’s BTRFS itself though, that i’m not sure about, recently i had a huge problem with BTRFS HDD disk i was experimenting after electricity failure it thrown out 158 bad sectors or something, it’s fsck variant is immature and made things even worse…So i’ve just backedup data and formated it to ext4 aka stable fs

Funny thing that disk was physically ok.

pebcak · January 18, 2022, 6:19pm

That is perhaps why I couldn’t just put it down to the BIOS update itself.

Perhaps I will wait with the reversal of the update and run a check on the filesystem first. But if it is going to worsen the situation…

pebcak · January 18, 2022, 6:27pm

Here is some smartctl info:

smartctl --all -H /dev/nvme0n1

smartctl 7.2 2020-12-30 r5155 [x86_64-linux-5.16.0-zen1-1-zen] (local build)
Copyright (C) 2002-20, Bruce Allen, Christian Franke, www.smartmontools.org

=== START OF INFORMATION SECTION ===
Model Number:                       Samsung SSD 970 EVO 500GB
Serial Number:                    
Firmware Version:                   2B2QEXE7
PCI Vendor/Subsystem ID:            0x144d
IEEE OUI Identifier:                0x002538
Total NVM Capacity:                 500,107,862,016 [500 GB]
Unallocated NVM Capacity:           0
Controller ID:                      4
NVMe Version:                       1.3
Number of Namespaces:               1
Namespace 1 Size/Capacity:          500,107,862,016 [500 GB]
Namespace 1 Utilization:            205,104,029,696 [205 GB]
Namespace 1 Formatted LBA Size:     512
Namespace 1 IEEE EUI-64:            002538 5801420402
Local Time is:                      Tue Jan 18 19:24:02 2022 CET
Firmware Updates (0x16):            3 Slots, no Reset required
Optional Admin Commands (0x0017):   Security Format Frmw_DL Self_Test
Optional NVM Commands (0x005f):     Comp Wr_Unc DS_Mngmt Wr_Zero Sav/Sel_Feat Timestmp
Log Page Attributes (0x03):         S/H_per_NS Cmd_Eff_Lg
Maximum Data Transfer Size:         512 Pages
Warning  Comp. Temp. Threshold:     85 Celsius
Critical Comp. Temp. Threshold:     85 Celsius

Supported Power States
St Op     Max   Active     Idle   RL RT WL WT  Ent_Lat  Ex_Lat
 0 +     6.20W       -        -    0  0  0  0        0       0
 1 +     4.30W       -        -    1  1  1  1        0       0
 2 +     2.10W       -        -    2  2  2  2        0       0
 3 -   0.0400W       -        -    3  3  3  3      210    1200
 4 -   0.0050W       -        -    4  4  4  4     2000    8000

Supported LBA Sizes (NSID 0x1)
Id Fmt  Data  Metadt  Rel_Perf
 0 +     512       0         0

=== START OF SMART DATA SECTION ===
SMART overall-health self-assessment test result: PASSED

SMART/Health Information (NVMe Log 0x02)
Critical Warning:                   0x00
Temperature:                        40 Celsius
Available Spare:                    100%
Available Spare Threshold:          10%
Percentage Used:                    0%
Data Units Read:                    9,057,169 [4.63 TB]
Data Units Written:                 8,667,317 [4.43 TB]
Host Read Commands:                 44,709,469
Host Write Commands:                82,364,873
Controller Busy Time:               397
Power Cycles:                       523
Power On Hours:                     372
Unsafe Shutdowns:                   140
Media and Data Integrity Errors:    0
Error Information Log Entries:      638
Warning  Comp. Temperature Time:    0
Critical Comp. Temperature Time:    0
Temperature Sensor 1:               40 Celsius
Temperature Sensor 2:               40 Celsius

Error Information (NVMe Log 0x01, 16 of 64 entries)
Num   ErrCount  SQId   CmdId  Status  PELoc          LBA  NSID    VS
  0        638     0  0x101a  0x4004      -            0     0     -

keybreak · January 18, 2022, 6:36pm

Looking good i think

pebcak · January 18, 2022, 8:23pm

A little update on the situation.

A couple of reboots later, I have been watching journalctl and dmesg in real time and I am not seeing any errors like the one I had before for BTRFS.

System has been running fine, from what I can tell at the surface of things, and no new Firefox crashes.

here below is a link to some entries in the logs on Firefox coredumping a a couple of boots ago:

http://ix.io/3MI2

ricklinux · January 18, 2022, 8:27pm

I see this?

Module libgpg-error.so.0 with build-id 3801187d42c4955bd93c605451430cdf1b164e63

EOS · January 18, 2022, 8:37pm

Strange. Maybe it fixed that file. (ino 2525649)
You could consider launching:
sudo btrfs scrub start /
and
sudo btrfs scrub status /

pebcak · January 18, 2022, 8:39pm

What would that mean?

libgpg-error.so.0 is provided by

Name            : libgpg-error
Version         : 1.43-1
Description     : Support library for libgcrypt
Architecture    : x86_64
URL             : https://www.gnupg.org
Licenses        : LGPL
Groups          : None
Provides        : None
Depends On      : glibc  sh
Optional Deps   : None
Required By     : gnupg  gpgme  libassuan  libgcrypt  libksba  ostree
Optional For    : None
Conflicts With  : None
Replaces        : None
Installed Size  : 1003.38 KiB
Packager        : Andreas Radke <andyrtr@archlinux.org>
Build Date      : Wed 03 Nov 2021 05:41:32 PM CET
Install Date    : Fri 05 Nov 2021 08:57:06 AM CET
Install Reason  : Installed as a dependency for another package
Install Script  : No
Validated By    : Signature

pactree -r libgpg-error

Is my system kaput?

libgpg-error
├─gnupg
│ └─gpgme
│   ├─gmime3
│   │ └─grilo-plugins
│   ├─ostree
│   │ └─flatpak
│   │   └─libpamac-full
│   │     └─pamac-all
│   ├─pacman
│   │ ├─appstream-glib
│   │ │ └─flatpak
│   │ ├─arch-audit
│   │ ├─arch-install-scripts
│   │ ├─base
│   │ ├─expac
│   │ ├─libpamac-full
│   │ ├─pacman-contrib
│   │ │ └─downgrade
│   │ ├─pacutils
│   │ ├─pkgfile
│   │ └─yay
│   └─volume_key
│     └─libblockdev
│       └─udisks2
│         ├─gnome-control-center
│         │ └─gnome-calendar
│         ├─gnome-disk-utility
│         │ └─gnome-shell
│         │   ├─gdm
│         │   ├─gnome-shell-extension-appindicator
│         │   └─gnome-shell-extensions
│         └─gvfs
│           ├─evince
│           │ └─xdg-desktop-portal-gnome
│           │   └─xdg-desktop-portal
│           │     └─flatpak
│           ├─gvfs-afc
│           ├─gvfs-goa
│           │ └─gvfs-google
│           ├─gvfs-gphoto2
│           ├─gvfs-mtp
│           ├─gvfs-nfs
│           ├─gvfs-smb
│           └─nemo
├─gpgme
├─libassuan
│ ├─gnupg
│ └─pinentry
│   └─gnupg
├─libgcrypt
│ ├─btrfs-progs
│ │ ├─libblockdev
│ │ └─snapper
│ ├─chromium
│ ├─gcr
│ │ ├─epiphany
│ │ ├─gnome-keyring
│ │ │ └─xdg-desktop-portal-gnome
│ │ ├─gnome-online-accounts
│ │ │ ├─evolution-data-server
│ │ │ │ ├─gnome-calendar
│ │ │ │ └─gnome-notes
│ │ │ ├─gnome-control-center
│ │ │ ├─gnome-notes
│ │ │ ├─gvfs-goa
│ │ │ └─libgdata
│ │ │   ├─evolution-data-server
│ │ │   ├─grilo-plugins
│ │ │   ├─gvfs-google
│ │ │   └─shotwell
│ │ ├─gnome-settings-daemon
│ │ │ ├─gnome-control-center
│ │ │ ├─gnome-shell
│ │ │ ├─gnome-tweaks
│ │ │ └─mutter
│ │ │   └─gnome-shell
│ │ ├─gnome-shell
│ │ ├─gvfs
│ │ ├─libgdata
│ │ ├─libnma
│ │ │ └─nm-connection-editor
│ │ │   ├─gnome-control-center
│ │ │   └─gnome-shell
│ │ └─shotwell
│ ├─gnupg
│ ├─gtk-vnc
│ │ ├─gnome-boxes
│ │ └─virt-manager
│ ├─keepassxc
│ ├─libsecret
│ │ ├─darktable
│ │ ├─evince
│ │ ├─gcr
│ │ ├─gnome-boxes
│ │ ├─gnome-disk-utility
│ │ ├─gnome-online-accounts
│ │ ├─gnome-remote-desktop
│ │ ├─gnome-shell
│ │ ├─gthumb
│ │ ├─gvfs
│ │ ├─networkmanager-openvpn
│ │ ├─pinentry
│ │ ├─vino
│ │ ├─webkit2gtk
│ │ │ ├─gnome-boxes
│ │ │ ├─gnome-notes
│ │ │ ├─gnome-online-accounts
│ │ │ ├─gthumb
│ │ │ ├─gufw
│ │ │ ├─shotwell
│ │ │ └─zenity
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│ │ │ │ │ └─libcheese
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│ │ │ │ ├─tracker3-miners
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│ │ │   ├─tracker-miners
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│ │ │ ├─mpv
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│ │ │ ├─at-spi2-core
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│ │ │ ├─ghostscript
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│ │ │ │ └─libimobiledevice
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│ │ │ │ │   │ │   ├─gegl
│ │ │ │ │   │ │   │ ├─gimp
│ │ │ │ │   │ │   │ └─libmypaint
│ │ │ │ │   │ │   │   ├─gimp
│ │ │ │ │   │ │   │   └─mypaint-brushes1
│ │ │ │ │   │ │   │     └─gimp
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│ │ │ │ │   │ │   └─tracker3-miners
│ │ │ │ │   │ ├─flickcurl
│ │ │ │ │   │ ├─git
│ │ │ │ │   │ │ └─yay
│ │ │ │ │   │ ├─gnome-notes
│ │ │ │ │   │ ├─gst-plugins-bad
│ │ │ │ │   │ ├─keepassxc
│ │ │ │ │   │ ├─klavaro
│ │ │ │ │   │ ├─libelf
│ │ │ │ │   │ │ ├─elfutils
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─binutils
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─gcc
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─dkms
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ │ └─virtualbox-host-dkms
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ │   └─virtualbox
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ └─virtualbox-host-dkms
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─mkinitcpio
│ │ │ │ │   │ │ │ │ └─perf
│ │ │ │ │   │ │ │ └─perf
│ │ │ │ │   │ │ ├─gstreamer
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─cheese
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─freerdp
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─gnome-shell
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─gst-plugins-base-libs
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─libcheese
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─webkit2gtk
│ │ │ │ │   │ │ │ └─webkit2gtk-4.1
│ │ │ │ │   │ │ ├─iproute2
│ │ │ │ │   │ │ ├─libbpf
│ │ │ │ │   │ │ │ └─qemu
│ │ │ │ │   │ │ ├─libva-mesa-driver
│ │ │ │ │   │ │ ├─mesa
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─cogl
│ │ │ │ │   │ │ │ │ └─clutter
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─gst-plugins-base-libs
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─gtk3
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─libglvnd
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─glu
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ └─simplescreenrecorder
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─gnome-session
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─gtk4
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─libplacebo
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ └─mpv
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─libva
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─chromium
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─ffmpeg
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─gst-plugins-bad
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─intel-media-driver
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─libva-utils
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ └─mpv
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─mesa
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─mpv
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─qt5-base
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─qt6-base
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─sdl2
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─simplescreenrecorder
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─webkit2gtk
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─webkit2gtk-4.1
│ │ │ │ │   │ │ │ │ ├─wpebackend-fdo
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ ├─webkit2gtk
│ │ │ │ │   │ │ │ │ │ └─webkit2gtk-4.1
│ │ │ │ │   │ │ │ │ └─xorg-server
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─mpv
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─qemu
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─qt5-base
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─qt6-base
│ │ │ │ │   │ │ │ └─virglrenderer
│ │ │ │ │   │ │ │   └─qemu
│ │ │ │ │   │ │ ├─openmp
│ │ │ │ │   │ │ │ └─darktable
│ │ │ │ │   │ │ ├─pahole
│ │ │ │ │   │ │ │ ├─linux-lts-headers
│ │ │ │ │   │ │ │ └─linux-zen-headers
│ │ │ │ │   │ │ ├─perf
│ │ │ │ │   │ │ └─systemd
│ │ │ │ │   │ ├─libgphoto2
│ │ │ │ │   │ ├─liboauth
│ │ │ │ │   │ │ └─grilo
│ │ │ │ │   │ ├─libofa
│ │ │ │ │   │ ├─networkmanager
│ │ │ │ │   │ ├─pacman
│ │ │ │ │   │ ├─pkgfile
│ │ │ │ │   │ ├─poppler
│ │ │ │ │   │ │ └─poppler-glib
│ │ │ │ │   │ │   ├─evince
│ │ │ │ │   │ │   ├─gegl
│ │ │ │ │   │ │   ├─inkscape
│ │ │ │ │   │ │   ├─tracker-miners
│ │ │ │ │   │ │   └─tracker3-miners
│ │ │ │ │   │ ├─qemu
│ │ │ │ │   │ ├─raptor
│ │ │ │ │   │ ├─virtualbox
│ │ │ │ │   │ ├─yubico-c
│ │ │ │ │   │ └─yubico-c-client
│ │ │ │ │   └─neon
│ │ │ │ │     └─gst-plugins-bad
│ │ │ │ ├─curl
│ │ │ │ └─neon
│ │ │ ├─gcr
│ │ │ ├─gnutls
│ │ │ │ ├─ffmpeg
│ │ │ │ ├─glib-networking
│ │ │ │ ├─gnupg
│ │ │ │ ├─gtk-vnc
│ │ │ │ ├─libcups
│ │ │ │ ├─libimobiledevice
│ │ │ │ ├─libnice
│ │ │ │ ├─libvirt
│ │ │ │ ├─libvncserver
│ │ │ │ ├─pkcs11-helper
│ │ │ │ │ └─openvpn
│ │ │ │ ├─qemu
│ │ │ │ ├─rtmpdump
│ │ │ │ │ └─gst-plugins-bad
│ │ │ │ ├─smbclient
│ │ │ │ ├─vino
│ │ │ │ ├─vte3
│ │ │ │ ├─wget
│ │ │ │ └─wireshark-cli
│ │ │ └─nss
│ │ │   ├─brave-bin
│ │ │   ├─chromium
│ │ │   ├─evolution-data-server
│ │ │   ├─firefox
│ │ │   ├─gnome-settings-daemon
│ │ │   ├─libcacard
│ │ │   │ ├─qemu
│ │ │   │ └─spice-gtk
│ │ │   ├─libnm
│ │ │   ├─liboauth
│ │ │   ├─libsrtp
│ │ │   │ └─gst-plugins-bad
│ │ │   ├─pkcs11-helper
│ │ │   ├─poppler
│ │ │   └─volume_key
│ │ ├─pcsclite
│ │ ├─pipewire
│ │ ├─procps-ng
│ │ │ ├─base
│ │ │ ├─gpm
│ │ │ │ ├─aalib
│ │ │ │ │ └─gst-plugins-good
│ │ │ │ └─libnewt
│ │ │ │   └─networkmanager
│ │ │ ├─intel-gpu-tools
│ │ │ ├─inxi
│ │ │ └─virtualbox
│ │ ├─python-systemd
│ │ │ └─fail2ban
│ │ ├─qemu
│ │ ├─smartmontools
│ │ ├─snapd
│ │ │ └─libpamac-full
│ │ ├─systemd
│ │ ├─tor
│ │ ├─usbutils
│ │ ├─util-linux
│ │ │ ├─apr
│ │ │ │ └─apr-util
│ │ │ │   └─apache
│ │ │ │     └─mod_dnssd
│ │ │ ├─arch-install-scripts
│ │ │ ├─base
│ │ │ ├─fakeroot
│ │ │ │ └─pacman-contrib
│ │ │ ├─gupnp
│ │ │ ├─mkinitcpio
│ │ │ ├─ntfs-3g
│ │ │ ├─ostree
│ │ │ ├─systemd
│ │ │ ├─tracker
│ │ │ ├─tracker3
│ │ │ ├─ventoy-bin
│ │ │ └─zeromq
│ │ │   └─libteam
│ │ ├─webkit2gtk
│ │ ├─webkit2gtk-4.1
│ │ ├─wireplumber
│ │ └─xorg-xwayland
│ │   └─mutter
│ ├─totem-pl-parser
│ │ ├─grilo
│ │ ├─tracker-miners
│ │ └─tracker3-miners
│ ├─webkit2gtk
│ ├─webkit2gtk-4.1
│ ├─wireshark-cli
│ └─wireshark-qt
├─libksba
│ └─gnupg
└─ostree

pebcak · January 18, 2022, 8:41pm

Thanks for the input!
I am going to scrub the filesystem with your suggested commands.

pebcak · January 18, 2022, 8:54pm

@EOS

Here is the output from scrub command:

$ sudo btrfs scrub start / 
       
scrub started on /, fsid 1d9646ea-0edf-423b-85a7-88a429c6314b (pid=4903)

 $ sudo btrfs scrub status / 
UUID:             1d9646ea-0edf-423b-85a7-88a429c6314b
Scrub started:    Tue Jan 18 21:50:31 2022
Status:           finished
Duration:         0:01:00
Total to scrub:   189.03GiB
Rate:             3.00GiB/s
Error summary:    no errors found

Would you recommend running a btrfsck as well on the drive?

keybreak · January 18, 2022, 8:57pm

This is super-creepy tool, like i’ve said above…at least for my experience, and actually they write about it on Arch wiki

https://wiki.archlinux.org/title/Btrfs#btrfs_check

pebcak · January 18, 2022, 9:04pm

It seems that there are some “safe or advisory” and some “dangerous” options:

https://btrfs.readthedocs.io/en/latest/btrfs-check.html

Since things seems to be running ok for now, perhaps I’d better to adopt a “wait-and-see” posture

keybreak · January 18, 2022, 9:04pm

Or downgrade-bios-and-see

EOS · January 18, 2022, 9:05pm

Error summary: no errors found

Nice.

Would you recommend running a btrfsck as well on the drive?

You’ll have to run it on a live CD if you want to check. Must be unmounted.
Don’t do BTRFSCK/BTRFS check –repair.

pebcak · January 18, 2022, 9:07pm

No, not that!

Warning

Do not use –repair unless you are advised to do so by a developer or an experienced user, and then only after having accepted that no fsck successfully repair all types of filesystem corruption. Eg. some other software or hardware bugs can fatally damage a volume.

https://btrfs.readthedocs.io/en/latest/btrfs-check.html

pebcak · January 18, 2022, 9:39pm

$ sudo btrfs check /dev/nvme0n1p2 
Opening filesystem to check...
Checking filesystem on /dev/nvme0n1p2
UUID: 1d9646ea-0edf-423b-85a7-88a429c6314b
[1/7] checking root items
[2/7] checking extents
[3/7] checking free space cache
[4/7] checking fs roots
[5/7] checking only csums items (without verifying data)
[6/7] checking root refs
[7/7] checking quota groups skipped (not enabled on this FS)
found 202959192064 bytes used, no error found
total csum bytes: 185202940
total tree bytes: 1425113088
total fs tree bytes: 1134903296
total extent tree bytes: 65863680
btree space waste bytes: 230205638
file data blocks allocated: 272827121664
 referenced 211354320896

found 202959192064 bytes used, no error found

Looks good!

While I was at it, I did:

$ sudo btrfs check --clear-ino-cache /dev/nvme0n1p2 
Opening filesystem to check...
Checking filesystem on /dev/nvme0n1p2
UUID: 1d9646ea-0edf-423b-85a7-88a429c6314b
Successfully cleaned up ino cache for root id: 5
Successfully cleaned up ino cache for root id: 256
Successfully cleaned up ino cache for root id: 257

as well.

–clear-ino-cache
clear ino cache leftover items

I think I can go back to

watching dmesg lines passing by on the screen.

What an exciting evening!